按照菏泽港“一港四区”总体发展规划，菏泽港巨野港区将新增２０００万吨级吞吐量的内河港口，即巨野港区万丰作业区一期工程项目。目前该项目公示信息已在山东省人民政府官网更新。
　　该项目预计建设１８个１０００吨级泊位，总长１４１４米，设计年吞吐量２０００万吨，可满足１０００－２０００吨级货船停靠。

万丰作业区处于新万福河主航道，新万福河复航一期工程的最西端，属于新万福河航道的核心货运码头，位于巨野、成武、定陶、牡丹区交汇处，临近龙固煤矿、万福煤矿、铁雄新沙等大型企业，区位优势、资源优势明显，目前该项目进展顺利。

新万福河复航工程全长６１．３公里，其中菏泽段约２０公里，航道设计底宽４５米，底高程２９．３米，设计水深４．５米。菏泽、济宁两市涉及跨河桥梁１５座，其中菏泽境内７座、济宁境内８座。
　　关于菏泽港
　　菏泽港位于菏泽洙水河、新万福河、郓城新河以及郓巨河４条通航河道内，为山东省地区性重要港口。

根据《菏泽港总体规划》，全市将建设洙水河、新万福河、郓城新河、郓巨河等４条航道，航道总长１０４．４公里。其中，洙水河航道目前已全线通航，该航线内的巨野港区麒麟作业区日吞吐量超过万吨；新万福河复航工程也已完成了航道工程、通航闸工程、桥梁工程交工检测，具备了试通航条件。

未来，菏泽港将形成以巨野港区为核心港区，成武港区、郓城港区、定陶港区为重要港区的“一港四区”的总体发展格局。四港区下设１０个作业区，分别为：巨野港区麒麟作业区、巨野港区万丰作业区、巨野港区柳林作业区、巨野港区田庄作业区、郓城港区杨庄集作业区、郓城港区郓城东作业区、郓城港区丁里长作业区、成武港区安济河作业区、成武港区南鲁集作业区、定陶港区杜堂作业区。

菏泽港“一港四区”总体发展规划的实施，有利于菏泽发展大港航、大物流，发挥港口货物集散地和中转站的作用，有力带动现代物流业和临港工业，实现水路、铁路、公路多种运输方式的便利中转，并由此带动周边地区第三产业发展，起到“经济发展、交通先行”的作用。